Η Αρχαιολογική Συλλογή Ανάφης φιλοξενεί ευρήματα, κυρίως γλυπτά, επιγραφές, και επιτύμβιες στήλες, που χρονολογούνται από τους ελληνιστικούς και τους ρωμαϊκούς χρόνους και προέρχονται από την αρχαία πόλη της Ανάφης (Καστέλλι) και άλλες αρχαιολογικές θέσεις του νησιού.
