Ο Καθεδρικός Ναός Αγίου Ιωάννη του Βαπτιστή βρίσκεται στα Φηρά Θήρας στην Ελλάδα και αποτελεί τον Καθεδρικό Ναό της Επισκοπής Σαντορίνης.
Ο Καθεδρικός Ναός βρίσκεται στο κέντρο της πόλης, εντός της Καθολικής συνοικίας. Η εκκλησία ανεγέρθηκε το 1823, ενώ ανακαινίστηκε και ανακατασκευάστηκε το 1970, λόγω των ζημιών που είχε υποστεί στην διάρκεια σεισμού το 1956. Το κτίριο είναι μπαρόκ αρχιτεκτονικής, ενώ τα χρώματά του είναι συνδυασμός του γκρι, του μπλε και του μπεζ.