Το Ναυτικό Μουσείο Αιγαίου ιδρύθηκε από το Μυκονιάτη Γιώργο Μ. Δρακόπουλο και την σύζυγό του Ιωάννα και λειτουργεί από το 1985. Στεγάζεται σε ένα κυκλαδίτικο σπίτι του 19ου αιώνα και βρίσκεται στο κέντρο της παραδοσιακής πόλης της Μυκόνου στη θέση Τρία Πηγάδια.