Ο Άγιος Ιωάννης Σπηλιώτης βρίσκεται στην είσοδο του Σπηλαίου της Αντιπάρου.
Ό Άγιος Ιωάννης επικοινωνεί εσωτερικά με το μικρότερο και παλαιότερο εκκλησάκι (350 ετών) της Ζωοδόχου Πηγής.
Η εκκλησία έχει δώσει το όνομά της σε ολόκληρη την τοποθεσία, η οποία ονομάζεται βουνάλι του Άη Γιάννη ή Αγιογιαννίτικο βουνό.
Η εκκλησία γιορτάζει κάθε χρόνο στις 8 Μαΐου.
Το εκκλησάκι του Άη Γιάννη ανακαινίστηκε το 1714 από τον Αντιπαριώτη Μητροπολίτη Ναυπάκτου και Άρτης Νεόφυτο Μαυρομμάτη, ο οποίος και συναρμολόγησε μία εικόνα του Αγίου που ήταν κομμένη σε δύο κομμάτια.
Η εκκλησία του Αγίου Ιωάννη Σπηλιώτη ανακαινίστικε ξανά πρόσφατα και είναι πιο όμορφη από ποτέ.
Κάθε χρόνο παραμονή και ανήμερα του Άη Γιαννιού, στις 7 και 8 Μαΐου γίνεται πανηγύρι με τοπικά εδέσματα και τσικουδιά.