Η Τρυπητή βρίσκεται 73 χλμ νότια του Ηρακλείου και 12 χλμ ανατολικά του Λέντα, σε μια μικρή κοιλάδα που σχηματίζεται στην έξοδο του Στενού Φαραγγιού που διαρρέει ο Αγιοσαββίτης ποταμός, ο οποίος αποτελεί το φυσικό όριο των κοινοτήτων Μιαμού και Βασιλικής. Το όνομα Τρυπητή το παίρνει από την εκκλησία της Παναγίας της Πρωτοσεπτεμβριανής, η οποία είναι κτισμένη μέσα σε σπηλιά στην έξοδο του φαραγγιού και πολύ κοντά στη θάλασσα. Για να έρθετε ως εδώ υπάρχουν δύο εναλλακτικές διαδρομές, και οι δύο με μακρύ χωματόδρομο. Η πρώτη διαδρομή γίνεται μέσω χωματόδρομου μήκους 6 χλμ που ξεκινάει από το λιμάνι του Λέντα στη Λούτρα και κατευθύνεται ανατολικά, διασχίζει το ακρωτήριο του Τράφουλα και φτάνει στην Τρυπητή μετά από πολύ τράνταγμα και πολλές εικόνες αυθεντικού άγριου κρητικού τοπίου. Μπορείτε να ξεκινήσετε κι από το χωριό Κρότος και να συναντήσετε τον ίδιο χωματόδρομο στην πορεία.
Η δεύτερη εναλλακτική είναι να οδηγήσετε 9 χλμ από το χωριό Βασιλική της Μεσαράς, στην οποία πάτε μέσω του χωριού Άγιοι Δέκα. Ο χωματόδρομος διασχίζει τα άγρια Αστερούσια Όρη και περνάει αρχικά στο πλάι του απροσπέάστου φαραγγιού του Αγίου Σάββα ή Τρυπητής με τους επιβλητικούς σχηματισμούς και το ελαιοδάσος του Αγίου Σάββα. Κοντά στην παραλία, στην τοποθεσία Στενό Φαράγγι, το φαράγγι γίνεται τόσο στενό που χωράει μόνο ένα αυτοκίνητο. Αυτό το σημείο, με τα ψηλά τοιχώματα που κοντεύουν να «φιληθούν» πολλά μέτρα πάνω από τα κεφάλια σας, είναι πραγματικά εκπληκτικό και αξίζει να το επισκεφτείτε, ακόμη κι αν έρθετε από τον άλλο δρόμο.
Όταν φτάσετε στη θάλασσα, θα αντικρύσετε μια μεγάλη ήρεμη ακρογιαλιά, με πεντακάθαρο ψιλό χαλικάκι και σκούρα πράσινα νερά. Στη παραλία υπάρχουν μερικά αλμυρίκια, αρκετά μέτρα από την ακτογραμμή, στα οποία μπορείτε να βρείτε σκιά. Στα δυτικά βρίσκεται το μικρό ακρωτήριο Φύλακας, πάνω στο οποίο υπάρχουν οι δέστρες του αρχαίου λιμανιού και φυσικές σπηλιές. Η παραλία δεν είναι πολύ οργανωμένη, αλλά παρόλα αυτά εδώ υπάρχει μικρή ταβέρνα. Επίσης, ειδικά τον Αύγουστο μαζεύει αρκετούς ντόπιους που διαμένουν σε αυθαίρετες κατασκευές, ενώ πλέον τα μόνιμα τοποθετημένα τροχόσπιτα αλλοιώνουν το φυσικό τοπίο.