Το Σπήλαιο της Ειλειθυίας βρίσκεται περίπου 7χλμ. ανατολικά από το Ηράκλειο και 1χλμ. νοτιοανατολικά της Αμνισού.
Κοντά στην είσοδο του σπηλαίου τα θεμέλια κτίσματος θεωρήθηκαν κατοικία των ιερέων ή φυλάκων. Επτά σκαλοπάτια οδηγούν σε βαθύτερο επίπεδο και στη συνέχεια ανηφορικός διάδρομος σε υψηλότερο θάλαμο πλάτους 10-12 μέτρων, ύψους 4 μέτρων, που είναι διαμορφωμένος σε 3 διαδοχικές αίθουσες με ανισόπεδο δάπεδο. Κοντά στην είσοδο βρίσκεται μια τεράστια πέτρα, ύψους 0.78μέτρων και διαμέτρου 2.20 μέτρων, που έχει τη μορφή “ομφαλού”.
Από τα ευρήματα συμπεραίνεται ότι το σπήλαιο ήταν λατρευτικός χώρος από τη νεολιθική εποχή μέχρι τον 5ο αιώνα μ.Χ. Κατά τη διάρκεια των ανασκαφών εντοπίστηκαν και ίχνη λατρείας της Παλαιοχριστιανικής περιόδου.
